Sekwencjonowanie pojedynczych komórek (sc-RNAseq) pozwala uzyskać informacje o sekwencji RNA z poszczególnych komórek przy użyciu technologii sekwencjonowania nowej generacji. Pozwala na badanie każdego regionu transkryptomu w zróżnicowanym środowisku komórkowym.
Jako usługodawca rozwiązań firm 10xGenomics i Scale Biosciences oferujemy proces realizacji projektów sekwencjonowania pojedyńczych komórek. Oferujemy doradztwo w zakresie izolacji i dostarczania komórek, konstrukcję bibliotek do NGS, sekwencjonowanie RNA-seq (Illumina) i analizę danych. Aby zapewnić wysoką jakość wyników badań, mapujemy dane sekwencjonowania do odpowiedniego transkryptomu referencyjnego i przeprowadzamy analizę QC za pomocą oprogramowania 10x Genomics Cell Ranger oraz różnicową analizę ekspresji genów za pomocą aplikacji Seurat. W zależności od indywidualnych potrzeb eksperymentalnych, wykonujemy analizę 3’ lub 5’ Gene Expression.
W budowie, prosimy o kontakt indywidualny.